Os produtos de publicação científica (artigos, capítulos e livros) constituem o principal indicador para quantificação da atividade qualificada do pesquisador. Por sua vez, publicar um artigo ou capítulo é o resultado de um processo que exige uma série de despesas como a manutenção de laboratórios, viagens científicas, pagamento de custos de tradução, inscrições em eventos, assinaturas de periódicos e compra de insumos. Aqueles docentes que não dispõem de recursos financeiros de agências de fomento ou de outras fontes para apoio à pesquisa freqüentemente usam recursos próprios para arcar com tais despesas o que pode limitar sua produtividade e desestimular seu empenho.
O auxílio publicação da UFF tem como finalidade repor parcialmente tais custos do pesquisador, bem como sinalizar o reconhecimento da Universidade em relação ao trabalho de seus cientistas, ao mesmo tempo, servindo como estímulo ao crescimento da pesquisa na Universidade.